AKI on osa AKAVA-yhteisöä. Koska AKIn jäsenet ovat korkeasti koulutettuja ja toimivat asiantuntijatehtävissä, AKAVA on luonnollinen keskusjärjestövalinta.
Julkisen sektorin (valtio, kunta, kirkko) neuvottelutoiminta on AKAVA-yhteisössä järjestetty niin, että neuvottelu- ja sopimusoikeudet ovat Julkisalan koulutettujen neuvottelujärjestöllä JUKOlla. Kirkon sektorilla JUKOn pääneuvottelijoina toimivat Esko Jossas (AKIn toimisto) ja Arja Vehmas (JUKOn toimisto).
AKI on solminut yhteistoimintasopimuksen kirkon alan suurimman henkilöstöjärjestön, Kirkon alat r.y:n kanssa. Yhteistoiminnan piirissä ovat ennen muuta neuvottelu- ja työmarkkinatoiminta ja paikallistasolla luottamusmiestoiminta.
Muita yhteistyötahoja:
Vakava
Kirkon työmarkkinalaitos
Kotimaa-yhtiöt